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DNAに大容量のデジタルデータを書き込む技術を開発したベンチャーとその周辺技術、シリコンバレーで巨額の投資を受けたTheranosの一連の顛末を取り上げ、バイオ系ベンチャーにおける技術開発の難しさ、格ゲーの大会の盛り上がり、おすすめの映画とマンガについて話しました。Show notes CATALOG…ボストンにあるDNAデータストレージ技術を開発しているベンチャー。 Startup packs all 16GB of Wikipedia onto DNA strands to demonstrate new storage tech…CATALOGは、16GBのwikipediaの全データをDNAに書き込んだと発表した。 Some good news from CATALOG (社内ブログ)…CATALOGの開発チームが最初のPOC実験によって、1kbのデータを初めて書き込むことに成功したときの興奮が伝わってくる。 Random access in large-scale DNA data storage. Nature Biotechnology, 2018…Microsoft社により開発されたDNAストレージ技術。DNAマイクロチップ上に合成された数十万種類のDNAにはデータの他にそのデータブロックを示す番地情報が同時に付与されている。この番地情報に相補的なDNA配列をプライマーとして利用することでPCRによってランダムアクセスを実現した。この手法により、200MB程度の動画データの読み書きがデモされた。 Next-Generation Digital Information Storage in DNA. Science 2012…Sriram KosuriとGeorge Churchらによるoligo chip synthesisを用いた最初のDNAデータストレージ論文。この研究では、PIでありながらもGeorge Churchはベンチに立ち、ピペットを握り実験したんだよと以前SriはSohに話してくれた。ちなみにSriはUCLAでPIとして独立後、Octantという製薬のベンチャーを立ち上げた。 パリティチェック (誤り訂正)…DNAデータストレージの場合は、合成や読み出し時のPCRやシーケンスのエラーなどを考慮し、補正する必要がある。 ランダムアクセス (Wikiped